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alignment_db_scripts
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slurm_scripts
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__init__.py
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…
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activate_conda_env.sh
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…
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alignment_data_to_fasta.py
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…
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build_deepspeed_config.py
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…
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colabfold_search.sh
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…
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convert_of_weights_to_jax.py
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…
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convert_v1_to_v2_weights.py
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…
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data_dir_to_fasta.py
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…
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deactivate_conda_env.sh
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…
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deepspeed_inference_test.py
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…
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download_alphafold_dbs.sh
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…
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download_alphafold_params.sh
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…
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download_bfd.sh
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…
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download_cameo.py
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…
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download_colabfold_envdb.sh
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…
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download_mgnify.sh
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…
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download_mmseqs_dbs.sh
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…
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download_openfold_params.sh
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…
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download_openfold_params_gdrive.sh
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…
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download_openfold_params_huggingface.sh
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…
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download_openfold_soloseq_params.sh
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…
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download_pdb70.sh
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…
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download_pdb_mmcif.sh
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…
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download_pdb_seqres.sh
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…
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download_roda_pdbs.sh
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…
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download_small_bfd.sh
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…
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download_soloseq_embeddings.sh
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…
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download_uniclust30.sh
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…
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download_uniprot.sh
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…
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download_uniref30.sh
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…
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download_uniref90.sh
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…
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expand_alignment_duplicates.py
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fasta_to_clusterfile.py
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…
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flatten_roda.sh
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…
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generate_alphafold_feature_dict.py
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…
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generate_chain_data_cache.py
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…
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generate_mmcif_cache.py
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…
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install_hh_suite.sh
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…
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install_third_party_dependencies.sh
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…
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precompute_alignments.py
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…
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precompute_alignments_mmseqs.py
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…
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precompute_embeddings.py
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…
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prep_mmseqs_dbs.sh
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…
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prep_proteinnet_msas.py
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…
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run_unit_tests.sh
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unpack_proteinnet.py
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utils.py
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…
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vars.sh
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…
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