Add Nexus license, readme, and copyright headers

git-svn-id: https://subversion.assembla.com/svn/qmcdev/trunk@6430 e5b18d87-469d-4833-9cc0-8cdfa06e9491

nexus/LICENSE

@@ -0,0 +1,45 @@
+
+Notice:
+
+Development work on Nexus was initiated by Jaron T. Krogel at UIUC in 2012.
+
+This software is distributed under the UIUC/NCSA Open Source License (below).
+
+-----------------------------------------------------------------------------
+
+
+		  University of Illinois/NCSA Open Source License
+
+Copyright (c) 2012, University of Illinois Board of Trustees.
+All rights reserved.
+
+Developed by:   
+  Jaron T. Krogel
+  Department of Physics, University of Illinois at Urbana-Champaign
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a
+copy of this software and associated documentation files (the
+``Software''), to deal with the Software without restriction, including
+without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish,
+distribute, sublicense, and/or sell copies of the Software, and to
+permit persons to whom the Software is furnished to do so, subject to
+the following conditions:
+
+        * Redistributions of source code must retain the above copyright 
+          notice, this list of conditions and the following disclaimers.
+        * Redistributions in binary form must reproduce the above copyright 
+          notice, this list of conditions and the following disclaimers in 
+          the documentation and/or other materials provided with the 
+          distribution.
+        * Neither the names of the NCSA, the University of Illinois, 
+          nor the names of its contributors may be used to endorse or promote 
+          products derived from this Software without specific prior written 
+          permission.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS
+OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, 
+FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL 
+THE CONTRIBUTORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR 
+OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, 
+ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR 
+OTHER DEALINGS WITH THE SOFTWARE.

nexus/README

@@ -0,0 +1,230 @@
+
+====================
+==  Nexus Readme  ==
+====================
+
+Contents
+  1) About Nexus
+  2) Installation instructions
+  3) Summary of library files 
+
+
+
+
+1. About Nexus
+======================================================================
+  
+  Nexus was written by Jaron T. Krogel starting in 2012 at UIUC.
+  Most of the code was developed at ORNL after Dec. 2012.
+
+
+
+
+2. Installation instructions (Linux only)
+======================================================================
+
+ a. Ensure that Python and NumPy are available
+ -------------------------------------------------
+
+   The vast majority Linux distributions come with Python pre-installed.
+  
+   To check for Python, type "python --version" at the command line.
+   You should see something like "Python 2.7.6".  Nexus is only 
+   compatible with Python 2.x (3.x is not yet supported).  If Python
+   is not present on your system, you can install it by following the 
+   instructions at:
+  
+     http://docs.python-guide.org/en/latest/starting/install/linux/
+  
+   With Python present, check for NumPy.  Type "python" at the command
+   line.  You will get an interactive prompt (">>>").  Now type 
+   "import numpy" then "numpy.__version__".  If the import is 
+   successful and your version number is greater than 1.6.x, then 
+   Nexus should work on your system.  If you need to install numpy, 
+   follow the instructions at:
+  
+     http://docs.scipy.org/doc/numpy/user/install.html
+  
+   Installation of NumPy on certain linux distributions is 
+   straightforward (e.g. via apt-get or yum).
+
+
+
+ b. "Install" Nexus
+ -------------------------------------------------
+   All that should be needed to get Nexus working on your system
+   is to add the path to its library files to the PYTHONPATH 
+   environment variable. 
+   
+   If the path to the directory this README file sits in is:
+   
+     /your/path/to/nexus/
+   
+   Then you can add one line to the .bashrc file in your 
+   home directory:
+   
+     export PYTHONPATH=/your/path/to/nexus/library/:$PYTHONPATH
+   
+   After adding this line, type "source $HOME/.bashrc".  Now check 
+   that Nexus is available by typing "python" then "import nexus".
+   You should be able to use Nexus if the the import proceeds 
+   without incident (i.e. no messages displayed).
+
+  
+
+
+3. Summary of important library files
+======================================================================
+
+ a. Core facilities
+ -------------------------------------------------
+
+   abilities.py, generic.py, developer.py 
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Abstract base classes for all Nexus classes.  Defines abilities 
+     such as querying, printing, etc.  Also provides developer 
+     interface functions such as error reporting and redirection for 
+     unimplemented base class functions.  Void class protects imports 
+     and halts execution if items from unavailable modules are 
+     encountered.
+ 
+   project_base.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~
+     Base class for core Nexus classes. Communicates settings 
+     information throughout the system.
+ 
+   project.py, nexus.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Central collection (imports) of all Nexus classes.  Interface 
+     to the "settings" function.
+ 
+   structure.py
+   ~~~~~~~~~~~~
+     Contains the Structure class and structure generator functions.
+ 
+   physical_system.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Contains PhysicalSystem class and particle information.
+ 
+   simulation.py
+   ~~~~~~~~~~~~~
+     Contains Simulation, SimulationInput, and SimulationAnalyzer 
+     base classes.  All core functionality of Simulation objects is 
+     defined here.  Also contains derived simulation classes (sim, 
+     input, analyzer) for generic simulation codes.  Enables driving 
+     of virtually any single or multi- input file simulation code by 
+     using input file templates.
+ 
+   machine.py
+   ~~~~~~~~~~
+     Contains Job, Machine, Workstation, and Supercomputer classes.
+     Also contains all derived Supercomputer classes (Titan, Edison, 
+     Mira, etc.)
+ 
+   project_manager.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Contains ProjectManager class.  Code controlling workflow 
+     management is generally shared between ProjectManager and 
+     Simulation.
+ 
+   bundle.py
+   ~~~~~~~~~
+     Contains a facility (the "bundle" function) for bundling 
+     many simulation jobs into a single, larger batch job.
+
+
+
+ b. Derived classes for specific simulation codes
+ -------------------------------------------------
+
+   QMCPACK
+   ~~~~~~~
+     Simulation:         qmcpack.py
+     SimulationInput:    qmcpack_input.py 
+     SimulationAnalyzer: qmcpack_analyzer.py
+   
+     Supporting analysis classes: 
+       qaobject.py, qmcpack_analyzer_base.py, 
+       qmcpack_method_analyzers.py, qmcpack_property_analyzers.py,
+       qmcpack_quantity_analyzers.py,qmcpack_result_analyzers.py,
+       spacegrid.py
+ 
+     Orbital conversion tools for QMCPACK:
+       convert4qmc.py, pw2qmcpack.py, wfconvert.py
+ 
+   PWSCF
+   ~~~~~
+     Simulation:         pwscf.py
+     SimulationInput:    pwscf_input.py    (read/write any input file)
+     SimulationAnalyzer: pwscf_analyzer.py (parse log output and data~file.xml)
+ 
+   VASP
+   ~~~~~
+     Simulation:         vasp.py
+     SimulationInput:    vasp_input.py    (read/write any input file)
+     SimulationAnalyzer: vasp_analyzer.py (parse OUTCAR and vasprun.xml)
+ 
+   GAMESS
+   ~~~~~~
+     Simulation:         gamess.py
+     SimulationInput:    gamess_input.py    (read/write any input file)
+     SimulationAnalyzer: gamess_analyzer.py (parse log output)
+ 
+   SQD
+   ~~~
+     Simulation:         sqd.py
+     SimulationInput:    sqd_input.py    
+     SimulationAnalyzer: sqd_analyzer.py 
+     
+   OPIUM
+   ~~~~~
+     opium.py contains all three (sim, input, analyzer)
+
+
+
+ c. Miscellaneous facilities
+ -------------------------------------------------
+
+   debug.py
+   ~~~~~~~~
+     Adds support for interactive code break points.
+ 
+   periodic_table.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Access to periodic table data in a structured object format.
+ 
+   numerics.py, extended_numpy.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Statistics and curve fitting support.
+ 
+   unit_converter.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Unit conversion of scalars and arrays.
+ 
+   xmlreader.py
+   ~~~~~~~~~~~~
+     Class to convert XML file into structured object format.
+ 
+   hdfreader.py
+   ~~~~~~~~~~~~
+     Class to convert HDF5 file into structured object containing 
+     numpy arrays.
+ 
+   fileio.py
+   ~~~~~~~~~
+     Interface to XSF files.  Other will go here later.
+ 
+   plotting.py
+   ~~~~~~~~~~~
+     Access to plotting functions via matplotlib.
+ 
+   pseudopotential.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Classes representing pseudopotentials.  Functions supporting 
+     pseudopotential conversion.
+ 
+   template_simulation.py
+   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+     Example and explanation for developers interested in 
+     implementing new derived Simulation classes for codes 
+     not yet supported by Nexus.

nexus/library/abilities.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 class genbase(object):

nexus/library/auxiliary.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 

nexus/library/bundle.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from machines import Workstation,Job
 from simulation import Simulation,NullSimulationInput,NullSimulationAnalyzer

nexus/library/cascade.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import string

nexus/library/convert4qmc.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 import os

nexus/library/converters.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from pw2qmcpack import Pw2qmcpack,Pw2qmcpackInput,Pw2qmcpackAnalyzer
 from wfconvert  import Wfconvert,WfconvertInput,WfconvertAnalyzer

nexus/library/debug.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import code
 

nexus/library/density_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,zeros,ndarray,around,sqrt,arange

nexus/library/developer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import sys
 import traceback

nexus/library/dft.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 from project_base import Pobj

nexus/library/differences.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 #! /usr/bin/env python
 
 import os

nexus/library/eos_fit.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from numpy import exp
 from developer import unavailable

nexus/library/execute.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from subprocess import Popen,PIPE
 

nexus/library/extended_numpy.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import sys
 
 from numpy import *

nexus/library/fileio.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,zeros,ndarray,around,arange,dot

nexus/library/gamess.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,ndarray,abs

nexus/library/gamess_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,ndarray,abs

nexus/library/gamess_input.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 import os

nexus/library/generator.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 #! /usr/bin/env python
 
 from types import FunctionType,StringType,DictType

nexus/library/generic.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import sys
 import traceback

nexus/library/graph.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from generic import obj
 from developer import DevBase,unavailable

nexus/library/hdfreader.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from numpy import array,ndarray,minimum,abs,ix_,resize
 import sys

nexus/library/machines.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import time

nexus/library/memory.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 _proc_status = '/proc/%d/status' % os.getpid()
 

nexus/library/nexus.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from project import *
 

nexus/library/numerics.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import types as pytypes
 from numpy import array,ndarray,zeros,linspace,pi,exp,sqrt,polyfit,polyval

nexus/library/opium.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/periodic_table.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 from generic import obj
 from developer import DevBase
 from unit_converter import UnitConverter

nexus/library/physical_system.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from numpy import dot,array
 from numpy.linalg import inv

nexus/library/plotter.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from abilities import AllAbilities
 

nexus/library/plotting.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 from developer import unavailable
 try:
     from matplotlib.pyplot import figure,plot,xlabel,ylabel,title,show,ylim,legend,xlim,rcParams,savefig,bar,xticks,subplot,grid,setp,errorbar,loglog,semilogx,semilogy,text

nexus/library/project.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 
@@ -26,7 +30,6 @@ from qmcpack import generate_jastrows,generate_jastrow,generate_jastrow1,generat
 from qmcpack import generate_cusp_correction
 from auxiliary import *
 from debug import *
-from plotting import *
 
 
 #set the machine if known, otherwise user will provide

nexus/library/project_base.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import traceback

nexus/library/project_manager.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import time

nexus/library/pseudopotential.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 #! /usr/bin/env python
 
 import os

nexus/library/pw2casino.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/pw2qmcpack.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/pwscf.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 from numpy import array
 from generic import obj

nexus/library/pwscf_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 from numpy import array,fromstring,sqrt
 from generic import obj

nexus/library/pwscf_data_reader.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array

nexus/library/pwscf_input.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 import types as pytypes
 from copy import deepcopy

nexus/library/qaobject.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from generic import obj
 from developer import DevBase

nexus/library/qmc.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from project_base import Pobj
 import qmcpack

nexus/library/qmcpack.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,dot,pi

nexus/library/qmcpack_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 #
 # bugs

nexus/library/qmcpack_analyzer_base.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from numpy import minimum,resize
 from generic import obj

nexus/library/qmcpack_calculations.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,empty

nexus/library/qmcpack_input.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 import types as pytypes
 import keyword

nexus/library/qmcpack_method_analyzers.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import re

nexus/library/qmcpack_pp_validation.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 #! /usr/bin/env python
 
 

nexus/library/qmcpack_property_analyzers.py

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+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 import os

nexus/library/qmcpack_quantity_analyzers.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import re

nexus/library/qmcpack_result_analyzers.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from numpy import array,empty,zeros,sqrt
 from generic import obj

nexus/library/qmcpack_variations.py

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+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 from datetime import datetime
 # jtk library imports

nexus/library/simulation.py

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+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import os
 import shutil
 import string

nexus/library/spacegrid.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 import re
 import copy
 from numpy import array,floor,sqrt,zeros,prod,dot,ones,empty,min,max

nexus/library/sqd.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/sqd_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import loadtxt,empty,array,abs

nexus/library/sqd_input.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 import types as pytypes

nexus/library/structure.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 #! /usr/bin/env python
 
 import os

nexus/library/superstring.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 '''
   superstring

nexus/library/template_simulation.py

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+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/unit_converter.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from abilities import Callable
 

nexus/library/vasp.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from generic import obj

nexus/library/vasp_analyzer.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,zeros

nexus/library/vasp_input.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 import os
 from numpy import array,abs,empty,ndarray

nexus/library/wfconvert.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 
 import os

nexus/library/xmlreader.py

@@ -1,3 +1,7 @@
+##################################################################
+##  (c) Copyright 2015-  by Jaron T. Krogel                     ##
+##################################################################
+
 
 from xml.parsers import expat
 from numpy import array

nexus/readme.txt

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-%%%%%%%%%%%%%%%%%
-||    Nexus    ||
-%%%%%%%%%%%%%%%%%
-
-
-Author:    Jaron T. Krogel
-
-1st Release:  24 May 2013
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-| Contents |
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-  - License Agreement
-  - For Nexus Users
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-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-| License Agreement |
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-  - since Nexus is currently distributed with QMCPACK it shares the same license
-  - see ../LICENSE
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-
-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-| For Nexus Users |
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-  - For installation and use, see the Nexus User Guide
-    |
-    - ./documentation/nexus_user_guide.pdf
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